Come trovare una sequenza parziale di cDNA

Le sequenze parziali di cDNA vengono ricercate spezzando chimicamente numerose coppie di una molecola di cDNA e creando, così, una serie di frammenti, la lunghezza di ciascuno dei quali differisce di una sola base da quella degli altri. In questo processo la base che si trova a una delle estremità viene fissata a un colorante fluorescente, il colore del quale dipende dall'identità della base. Alcune apparecchiature separano i frammenti così marcati in base alla loro lunghezza, e infine un raggio laser eccita, una per volta, le molecole di colorante. Il risultato è una sequenza di colori che può essere letta elettronicamente e che corrisponde all'ordine delle basi presenti alle estremità dei frammenti di cDNA analizzati. Sequenze parziali di qualche centinaio di basi possono essere analizzate da un computer che le ordina, producendo sequenze genetiche complete. ( CD-ROM Le Scienze 1997)